J'ai connu un adulte qui en avait plusieurs dans une oreille, le vétérinaire avait dit de ne pas y toucher, mais de surveiller qu’elles ne se répandent pas hors de l'oreille.
De plus il est effectivement courant de voir des verrues chez les poulains (mais dans les oreilles je ne sais pas) et elles partent quand le poulain a fini de développer son immunité.
Du coup à ta place je surveillerais sans m’inquiéter.